Langkah kerajaan dibawah kementerian pelajaran untuk menambah baik Sistem Pentaksiran Berasaskan Sekolah (PBS) adalah wajar dilakukan. Kementerian Pelajaran melalui Menteri yang bertanggunjawab mengatakan bahawa sistem PBS yang ada sekarang masih baru dan memerlukan masa untuk di adaptasikan. Oleh itu banyak ruang lagi yang boleh diperbaiki terhadap sistem tersebut. Masalah mengenai PBS ini disuarakan oleh Kesatuan Perkhidmatan Perguruan Kebangsaan (NUTP) dan terdapat juga keluhan-keluhan dari guru-guru yang mengunapakai sistem ini. Antara masalah yang sering dihadapi oleh guru-guru ialah :
- Kelewatan pangkalan data
- Sistem sukar di akses
- Guru kurang faham kaedah pentaksiran kerana terdapat perbezaan antara versi manual dan secara online.
- Bebanan kerja tambahan kepada guru-guru dalam penilaian.
- Bagi sekolah pedalaman yang sukar mendapat akses internet, guru-guru terpaksa pergi ke kawasan bandar atau pekan yang mempunyai akses internet untuk mengisi hasil pentaksiran yang dilakukan secara manual.